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Cell:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序深度解析三陰乳腺癌
行業(yè)新聞 2018-07-18


  美國(guó)MD安德森癌癥中心聯(lián)合瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員利用單細(xì)胞測(cè)序?qū)θ幦橄侔┱归_(kāi)分析,表明耐藥性是來(lái)源于現(xiàn)有的帶有基因突變的克隆。這些結(jié)果于周四發(fā)表在《Cell》雜志上,將對(duì)這種癌癥的診斷、預(yù)后和治療具有臨床意義。

  三陰乳腺癌是指雌激素受體、孕激素受體和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。這種癌癥約占乳腺癌的10%-15%,可能對(duì)新輔助化療有反應(yīng),但通常會(huì)產(chǎn)生耐藥性。不過(guò),人們尚不清楚耐藥性究竟是由罕見(jiàn)的現(xiàn)有克隆引起,還是由新獲得的基因組異常引起。

  于是,美國(guó)MD安德森癌癥中心聯(lián)合瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究人員利用單細(xì)胞測(cè)序對(duì)三陰乳腺癌展開(kāi)分析,表明耐藥性是來(lái)源于現(xiàn)有的帶有基因突變的克隆。這些結(jié)果于周四發(fā)表在《Cell》雜志上,將對(duì)這種癌癥的診斷、預(yù)后和治療具有臨床意義。


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  “在這項(xiàng)研究中,我們研究了三陰乳腺癌患者在接受新輔助化療時(shí)腫瘤細(xì)胞的基因組和表型進(jìn)化,他們表現(xiàn)出兩種截然不同的克隆動(dòng)態(tài):消退或持續(xù),”作者寫道。

  對(duì)于一些乳腺癌患者,化療清除了所有的腫瘤細(xì)胞。然而,另一些患者在化療后仍有殘留的腫瘤細(xì)胞,其基因型和表型在治療后都發(fā)生改變。



  為此,研究人員利用單細(xì)胞DNA和RNA測(cè)序,以及大量細(xì)胞的外顯子組測(cè)序,分析了20名治療過(guò)程中的三陰乳腺癌患者。Illumina深度外顯子組測(cè)序發(fā)現(xiàn)10名患者的腫瘤消退,而另10名患者仍有腫瘤細(xì)胞存在。之后,他們對(duì)其中的8名開(kāi)展了單細(xì)胞分析。

  他們使用BD的FACSAria II流式細(xì)胞儀來(lái)分選單個(gè)細(xì)胞,并利用混合文庫(kù)和Illumina的新一代測(cè)序技術(shù)來(lái)分析。他們通過(guò)DNA測(cè)序分析了900個(gè)單細(xì)胞,通過(guò)RNA測(cè)序分析了6,862個(gè)細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)化療中出現(xiàn)的拷貝數(shù)畸變是預(yù)先存在且適應(yīng)性選擇的,而表達(dá)譜是通過(guò)轉(zhuǎn)錄重編程獲得的。


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  “我們的數(shù)據(jù)進(jìn)一步表明,新輔助化療選擇的一小部分基因型被用于轉(zhuǎn)錄重編程,并在治療之前表達(dá)出耐受化療的基因,”研究人員指出。盡管這項(xiàng)研究的樣本量很小,但是它對(duì)臨床具有重要意義。

  作者還寫道:“在接受化療之前,檢測(cè)三陰乳腺癌患者的耐藥克隆,也許有助于預(yù)測(cè)哪些患者有望從化療中受益。其次,將患者分化為克隆消退組和克隆持續(xù)組,可能對(duì)患者的預(yù)后或生存有意義。第三,我們關(guān)于耐藥表型的數(shù)據(jù)有望開(kāi)發(fā)出克服耐藥性的治療策略。”

  未來(lái)的研究將包括配對(duì)的原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤的分析,以便了解耐藥克隆在轉(zhuǎn)移中的作用。研究人員表示,隨著單細(xì)胞DNA測(cè)序的產(chǎn)量增加及成本下降,以及同一細(xì)胞的單細(xì)胞DNA和RNA分析變得可行,這些項(xiàng)目將變得更加可行。


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