評估海洋哺乳動物哨兵物種的健康狀況對于了解環(huán)境擾動對海洋生態(tài)系統(tǒng)和人類健康的影響至關(guān)重要。在北極地區(qū),白鯨(Delphinapterus leucas)是高等級捕食者,可能作為哨兵物種,可能預(yù)測對人類健康的影響。雖然血液轉(zhuǎn)錄組的基因表達譜已被廣泛用于評估人類和獸醫(yī)的健康狀況和環(huán)境暴露,但由于缺乏可用的基因組和基線數(shù)據(jù),其在野生動物中的應(yīng)用受到限制。
為此,國家沿海海洋科學中心的研究人員在2012 - 2014年期間,在健康的布里斯托爾灣,AK庫存的年度健康評估期間收集的樣本中構(gòu)建了一個白鯨鯨血液轉(zhuǎn)錄組,以建立白鯨血液轉(zhuǎn)錄組的含量和變異的基線信息。來自白鯨的Trinity轉(zhuǎn)錄組裝配由91,325個轉(zhuǎn)錄本組成,代表了廣泛的細胞功能和過程,其內(nèi)容與另一種鯨類海豚的血液轉(zhuǎn)錄組非常相似。白鯨(25%TPM,每百萬轉(zhuǎn)錄本)的血紅蛋白轉(zhuǎn)錄物表達低于許多其他哺乳動物。已鑒定出白鯨的HBB序列中的T12A氨基酸取代,但不是寬吻海豚,并且可能在低溫適應(yīng)中起作用。
白癜風血液轉(zhuǎn)錄組在性別和年份之間比較穩(wěn)定,通過主成分分析沒有明顯的樣本聚類,<4%的基因差異表達(ebseq,fdr>
本研究提供了大量關(guān)于白鯨的轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù),并提供了大量初步數(shù)據(jù),以便與白鯨的其他研究進行比較。4%的基因差異表達(EBseq,F(xiàn)DR<0.05)。雖然需要建立季節(jié),性成熟,疾病和地理對白鯨血液轉(zhuǎn)錄組的影響,但涉及壓力,解毒和免疫功能的轉(zhuǎn)錄物的存在表明血液基因表達分析可提供有關(guān)健康狀況和暴露的信息。本研究提供了大量關(guān)于白鯨的轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù),并提供了大量初步數(shù)據(jù),以便與白鯨的其他研究進行比較。和免疫功能表明,血液基因表達分析可以提供有關(guān)健康狀況和暴露的信息。本研究提供了大量關(guān)于白鯨的轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù),并提供了大量初步數(shù)據(jù),以便與白鯨的其他研究進行比較。和免疫功能表明,血液基因表達分析可以提供有關(guān)健康狀況和暴露的信息。
本研究提供了大量關(guān)于白鯨的轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù),并提供了大量初步數(shù)據(jù),以便與白鯨的其他研究進行比較。
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