隨著二代單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)和三代測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,生物研究領(lǐng)域發(fā)生了巨大的變化。在過(guò)去,想要從大量細(xì)胞中獲得足夠多的細(xì)胞DNA進(jìn)行測(cè)序,因此測(cè)序的結(jié)果是這些細(xì)胞“整體”的表征;然而,由于細(xì)胞的異質(zhì)性,同一表型細(xì)胞的遺傳信息可能會(huì)存在差異,許多低豐度信息將在整體表征中丟失;而單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)運(yùn)而生,解決了傳統(tǒng)高通量測(cè)序帶來(lái)的的局限性。
單細(xì)胞懸液測(cè)序技術(shù)是指對(duì)在單個(gè)細(xì)胞上,對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組進(jìn)行的高通量測(cè)序分析的新技術(shù)。它可揭示單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),反映細(xì)胞之間的異質(zhì)性,在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等行業(yè)領(lǐng)域發(fā)揮了重要作用。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用
1、應(yīng)用于腫瘤研究
深圳華大基因研究所在腫瘤研究方面取得了突破性進(jìn)展,并在國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》上發(fā)表了研究論文。這項(xiàng)工作開(kāi)發(fā)了一種解析單細(xì)胞基因組的新方法,并將其應(yīng)用于腫瘤內(nèi)部遺傳特征的研究,研究原發(fā)性血小板增多癥和腎透明細(xì)胞癌;這種新方法解決了以前無(wú)法解決的高腫瘤異質(zhì)性問(wèn)題,為深入研究癌癥的發(fā)生、發(fā)展機(jī)制和診斷提供了新的研究思路和研究方向。
研究人員在單細(xì)胞水平上分析了腦瘤的基因組,并在人腦瘤樣本中確定了癌癥干細(xì)胞及其分化后代。研究人員分析了6個(gè)早期少突膠質(zhì)細(xì)胞樣本的4000多個(gè)腫瘤細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞可分為三類(lèi)。其中一個(gè)更像神經(jīng)干細(xì)胞,另外兩個(gè)有一定的分化特征。結(jié)果表明,癌癥干細(xì)胞是少突膠質(zhì)細(xì)胞瘤的主要生長(zhǎng)來(lái)源,這些細(xì)胞將成為有前途的治療目標(biāo)。
2、應(yīng)用于微生物的研究
在微生物領(lǐng)域,單細(xì)胞測(cè)序也取得了重大突破。2017年,來(lái)自美國(guó)的2017年UCSF原核生物實(shí)現(xiàn)了微生物單細(xì)胞懸液測(cè)序技術(shù)。