2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學軟件組成，能夠?qū)覫llumina測序儀。
長的非編碼RNA(lncRNA)正在成為組織生理學和疾病過程(包括癌癥)的重要調(diào)節(jié)劑。為了描繪全基因組lncRNA表達，密歇根大學的研究人員從來自25項獨立研究的超過43 Tb序列的腫瘤，正常組織和細胞系中策劃了7,256個RNA測序(RNA-seq)文庫。他們將ab initio裝配方法應用于該數(shù)據(jù)集，產(chǎn)生了91,013個表達基因的共有人轉(zhuǎn)錄組。
超過68%(58,648)的基因被分類為lncRNAs，其中79%以前未被注釋。大約1%(597)的lncRNA含有超保守的元素，7%(3,900)與疾病相關(guān)的SNP重疊。為了優(yōu)先考慮譜系特異性，疾病相關(guān)的lncRNA表達，研究人員采用非參數(shù)差異表達測試并提名7,942個譜系或癌癥相關(guān)的lncRNA基因。這里描述的lncRNA景觀可以闡明正常生物學和癌癥發(fā)病機理，并且可能對未來的生物標志物開發(fā)有價值。
誠邀各大測序公司及技術(shù)服務公司一起合作，為單細胞測序的發(fā)展貢獻力量。有合作意向請撥打：021-57790908，郵箱：zhujianming0374@163.com
轉(zhuǎn)摘請注明出處：謝謝配合
滬公網(wǎng)安備31011702889603號 網(wǎng)站地圖